504.“鬼”村-《最终诊断》


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    但是,这里却有两点不对劲。

    一方面,文献搜索CASP10这四个外显子缺失,发现日本报道了一个家庭,父亲和两个孩子三口都有这四个外显子缺失,却没有一人患上ALPS,而只有一个孩子得了关节炎,里面集合了20万人的基因组数据信息,并且根据这些信息做了很多有意义的分析。

    在gnomAD数据库上,我发现CASP10这个基因,人群中有较高比例的人有着预测可以导致功能完全丧失。

    意思是说,一个人有两条染色体,每条常染色体上有分别来自父母的一套相同的基因,这上面如果某个基因即使完全失去功能,只要另外一个没问题,对个体健康就不会有影响。

    也就是说CASP10这个基因,人群中本来就有不少人(两个基因之一)是完全没有功能的,而这些人完全健康。

    所以问题来了,CASP10的致病变异是怎么导致ALPS的,为啥这个病还是常染色体显性遗传病?

    继续深入的查了一下文献,原来CASP10的致病变异导致ALPS的机制是dominantnegativeeffect(“显性负效应”),而不是haploinsufficiency(“单倍不足”)。

    Haploinsufficiency的意思是说,当一个人来自两个染色体的两个相同基因中,如果有一个功能完全丧失的话,只有另外一个是不够用的,会导致疾病。

    上面通过人群基因数据的推导也显示,CASP10致病基因导致ALPS并非这种情况。

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    有人也许会好奇,如果CASP10基因两个染色体上的功能都全部丧失会怎么样?虽然目前并没有这样的病例报道,但考虑该基因对关键生理过程的重要调节意义,我猜测生命会无法存活,直接在胚胎阶段就自然流产了吧。

    总而言之,该患儿的基因检测结果,不支持其有可导致ALPS的致病基因变异,也非导致患儿中性粒细胞减少的原因。基因检测报告上的判读是错误的,该错误来源于对CASP10基因导致ALPS机制的不理解。

    随着二代测序技术的普及,我国越来越多的患者有机会做上全外显子层面的基因检测。

    然而我国这些检查,医院一般都是送到商业公司检测,这些公司的水准参差不齐,有时会有错误判读的情况。

    

    

    

    

      


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